論文情報 Sun et al., "Structure-Based Analysis of Cryptic-Site Opening", Structure 28, 1-13, 2020. doi: 10.1016/j.str.2019.11.007 どんなもの？ APO構造の中には、薬剤結合するには浅すぎる/小さすぎる Cryptic siteというものが存在することが多い…

その後の話を書きます。 2019年5月22日に日本学術振興会 特別研究員の証明書（プラスチックのカード）が届いたとの事務からの連絡があり、ここで初めて正式に採用されていることが確認できました。 併せて頂いた採用通知は4月25日付けになっており、これは特…

この記事は大体自分の最近の論文を見ているときに見かけたものの備忘録です。 最近DeepChemとか、化合物やタンパク質の世界にもDeep Learning、流行ってますよねぇ（最近って何年前からの話だよ…）。 Deep Learningをする上で（機械学習をする上で）、どんな…

最近MDシミュレーションをはじめて、はえー結構ちゃんと整備されてるのねぇーとか思いつつ。 amberのツールを使って、MDの結果を解析しようと思ったところ、pytrajというpython notebook形式でMDの結果を解析できるツールを発見したものの、cpptrajでいうunw…

4/1から学振PDで東大に着任することになったわけですが、行っても辞令を交付されるわけでもなく、雇用を証明するものもなく。 3月末まで所属していた東工大は「特別研究員」という肩書を得ることで様々なものにアクセスできるようにしているようなのですが、…