2019-04-01から1ヶ月間の記事一覧

化合物やタンパク質などなどのデータセットについてまとめてみる

この記事は大体自分の最近の論文を見ているときに見かけたものの備忘録です。 最近DeepChemとか、化合物やタンパク質の世界にもDeep Learning、流行ってますよねぇ(最近って何年前からの話だよ…)。 Deep Learningをする上で(機械学習をする上で)、どんな…

unwrapはcpptraj専用、pytrajではできない

最近MDシミュレーションをはじめて、はえー結構ちゃんと整備されてるのねぇーとか思いつつ。 amberのツールを使って、MDの結果を解析しようと思ったところ、pytrajというpython notebook形式でMDの結果を解析できるツールを発見したものの、cpptrajでいうunw…

学振PDの身分について

4/1から学振PDで東大に着任することになったわけですが、行っても辞令を交付されるわけでもなく、雇用を証明するものもなく。 3月末まで所属していた東工大は「特別研究員」という肩書を得ることで様々なものにアクセスできるようにしているようなのですが、…